2013年4月，经教育部批准，吉林农业科技学院在农业建筑环境与能源工程(建筑方向）专业的师资及实验室基础上设立了土木工程本科专业，同年开始招生。2017年，顺利通过吉林省普通高等学校学士学位授权专业审核。2013年、2015年、2017年、2019年制订4次人才培养方案，2021年对2019年培养方案进行修订。2018年与北京燕波工程管理有限公司等企业校企合作举办订单班，采取3+1+1培养模式。

现有专任教师9人，副教授3人，高级工程师1人，讲师4人，助教2人。“双师双能型”型教师7人。外聘企业教师4人，高级工程师2人，工程师2人。主持纵向项目7项，发表省级论文共16篇。横向项目2项，外观设计专利4项，实用新型专利2项，软件著作1项。主持吉林省高等教育学会1项，校级教研课题重点1项，一般2项。《建筑材料》获批2020年吉林省精品在线开放课程。立项校级大学生创新创业训练计划项目4项、省级大学生创新创业训练计划项目5项、国家级大学生创新创业训练计划项目1项；参加“结构模型设计大赛、“斯维尔杯”建筑信息模型（BIM）应用技能大赛、挑战杯”等学科竞赛，获省级及以上奖项共40多项，获奖校级以上互联网+大赛25项，参与学生达110人次。

土木工程专业拥有实验（实训）室共16个，实验室设备齐全，实验室总面积1900余平方米，仪器设备984余万元，处于同类院校中较先进的水平。其中，水利与土木综合实验室获省财政专项272万元（2016年），能够满足土木工程专业教学要求。2019年与吉林省求实建设软件有限公司建设《校企共建实训室》1个；2020年创建《教育部协同育人实践基地》1个；2021年与盈建科《共建实践条件和实践基地》1个；2022年，获批《吉林农业科技学院--水利土木工程实训中心耕读教育实践基地》1个。与北京市燕波工程管理有限公司签订“燕波订单班”，土木工程专业与吉林凇江建设开发有限公司、吉林市市政工程设计院有限责任公司、吉林市建铭监理有限责任公司、吉林市路桥工程建设有限责任公司等二十多家企业共建实习实训基地，签订了校企合作协议，开展了多方位、多样化的校企合作，作为学生就业实习基地。

本专业适应经济社会发展需要，开设建筑工程的施工、管理两个方向，培养建筑市场技术人才和管理人才。本专业要求学生掌握土木工程建设、运营、管理所必需的基本理论、基本知识和基本技能，具备房屋建筑、道桥、地下建筑等工程的规划、施工、管理、运营等方面的基本能力。专业长期立足吉林，服务东北，面向全国，培养了大批在土木工程设计、施工、监理、咨询等方面工作的应用型人才。十年来，已为社会培养输送了300余名毕业生。学生就业单位广泛，平均就业率达88%以上，部分学生考取了硕士研究生、入伍、西部计划等。